计算


 国家天文台“老虎”GPU高性能计算集群运行报告


信息与计算中心承担着国家天文台高性能计算基础设施的运行和维护任务。国家天文台现有两套集群系统,基本情况详述如下:

一.GPU集群

1. 基本情况及性能指标

性能描述:85个计算节点,通过Infiniband高速网络连接;每个节点安装了2个4核的Xeon E5520中央处理器,24GB内存,CPU理论峰值为1.5万亿次;每个节点安装了2块Nvidia C1060图形加速卡,理论单精度浮点计算峰值约为160万亿次。

2. 使用手册

GPU集群安装有LSF作业管理系统,用户无需指定具体的计算主机,只需在脚本中描述作业要求。提交后,LSF能自动为你安排运行。快速入门手册请阅读《Laohu Cluster User Manual(2013年6月4日更新)

3. LSF详细使用向导

LSF 命令参考手册

Running Jobs with Platform LSF

4. 实时运行情况

http://laohu.bao.ac.cn/ganglia/

二.    深腾6800集群

1. 概况

6800集群共有32个可用主机结点,每个结点包含4个Intel Itanium2 1.3GHz CPU、8/16G内存、千兆网卡,共享16T的存储空间。集群安装了PBS作业管理系统,所有用户作业需要使用PBS的命令来提交,不能直接使用mpirun来运行。

2. 性能指标

最近,我们对6800集群进行了一次linpack测试,测试结果如下:

- The matrix A is randomly generated for each test.
- The following scaled residual check will be computed:
      ||Ax-b||_oo / ( eps * ( || x ||_oo * || A ||_oo + || b ||_oo ) * N )
- The relative machine precision (eps) is taken to be               1.110223e-16
- Computational tests pass if scaled residuals are less than                16.0

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T/V       N    NB     P     Q               Time            Gflops
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WR13R2C8   100000  32  4   16         149703.17             4.453e+00
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||Ax-b||_oo/(eps*(||A||_oo*||x||_oo+||b||_oo)*N)=     0.0015076 …… PASSED
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WR13R2C8  50000   32  8   16           9067.04           9.191e+00
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||Ax-b||_oo/(eps*(||A||_oo*||x||_oo+||b||_oo)*N)=     0.0019862 …… PASSED
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3. 使用手册

简易使用手册下载

三.帐户申请

欢迎国台各研究部门的高性能并行计算应用课题,申请应用本系统,并鼓励国内其他兄弟单位合作使用,如果需要申请帐号,请填写以下表格,并发送至“netadmin (at) nao.cas.cn”。 机群所有用户的应用研究成果(包括但不仅限于科研课题成果、文章,程序,算法)需要提交给 我们一份,并且应当在适当的位置(如文章的“前言”或“致谢”中),注明应用中国科学院国家天文台超级计算机群,并将成果的相关信息发送至“netadmin (at) nao.cas.cn”,以便统计。这样也能更好地为集群用户提供服务,谢谢!

申请表格下载

四.软件下载

SSH Secure Shell for Workstations 3.2.9 软件下载

SSH Secure Shell for Workstations 使用手册